El Doctorado en Historia y Estudios Regionales está adscrito al Instituto de Investigaciones Histórico-Sociales, ubicado en la calle Diego Leño número 8, en el centro de la ciudad de Xalapa. Las instalaciones cuentan con una biblioteca en la que se resguarda lo más reciente en cuanto a publicaciones de las áreas de ciencias sociales: historia, sociología, educción, arqueología, antropología y ciencias políticas; un auditorio para 70 personas, un centro de cómputo, un salón de clases; todos los espacios cuentan con acceso a internet.