De una sinergia de las LGAC de los Cuerpos Académicos, se obtienen las LGAC del programa de la Maestría en Ingeniería de Procesos, incluyendo a todos los integrantes del NAB, como se muestra en la siguiente tabla:
| Línea de Generación y/o Aplicación del Conocimiento | Descripción | Profesores por LGAC |
| LGAC 1. Ingeniería de los Procesos Químicos |
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Dr. Hugo Pérez Pastenes |
| Dra. Sara Núñez Correa | ||
| Dr. Miguel Ángel Morales Cabrera | ||
| Dr. Javier Garrido Meléndez | ||
| Dr. Lucio Álvarez Pérez | ||
| LGAC 2. Ingeniería de los Procesos Biotecnológicos y Ambientales |
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Dr. Oswaldo Guzmán López |
| Dra. Heidi Patricia Medorio García | ||
| Dra. María del Carmen Cuevas Díaz | ||
| Dr. Israel de Jesús López Prieto |
LGAC 1. Ingeniería de los Procesos Químicos
Síntesis, caracterización y aplicación de materiales avanzados, incluyendo la simulación y modelado por CFD, en diversas ramas de la Ingeniería de Procesos. En relación a la industria química de interés, se desarrollan procesos no agresivos al medio ambiente y capaces de alcanzar altas conversiones hacia productos deseados. Se desarrolla y aplica tecnología de vanguardia enfocada a la prevención y remediación ambiental, así como elementos asociados a la mejora de la productividad y competitividad de una industria química más limpia y sustentable que permita contribuir hacia la conservación de la biodiversidad y estilos de vida empáticos con el medio ambiente.
LGAC 2. Ingeniería de los Procesos Biotecnológicos y Ambientales
Tiene como objetivo investigar conocimiento básico sobre procesos de bio-conservación de residuos, diseñar, construir y operar reactores biológicos y electroquímicos; para su aplicación en procesos de transformación mediante el uso de microbiología industrial, catálisis enzimática, biología molecular para la obtención de metabolitos. Además, contempla el estudio del deterioro ambiental y de los procesos de contaminación de agua, aire y suelo a través de la determinación de parámetros fisicoquímicos y microbiológicos para la calidad de los mismos, permitiendo la aplicación de tecnologías fisicoquímicas y biológicas innovadoras que mitigan los efectos adversos a los ecosistemas.