Nombre del Curso:
Aprendiendo R para analizar transcriptomas
Instructor:
Dr. Juan Caballero Pérez (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad LANGEBIO).
Fechas:
Inicio: 24 de Noviembre de 2016 – Término: 26 de Noviembre de 2016.
Horario:
Jueves, Viernes y Sábado de 9:00 a 14:00 hrs y de 15:00 a 20:00 hrs. Total: 30 horas.
Dirigido a:
Alumnos de Licenciatura y Posgrado (incluyendo Especialidades, Maestría y Doctorado).
Objetivo general:
Proporcionar las bases conceptuales de la transcriptómica comparativa e impartir conocimiento en el área de la bioinformática como medio facilitador para la interpretación y análisis de datos transcriptómicos.
Temario:
I. Introducción a R.
II. Uso de R en análisis estadísticos.
III. Lectura/escritura de datos.
IV Instalación de paquetes.
V. Tipos de datos en R.
VI. Manipulación de “data frames”.
VII. Manipualción de vectores.
VIII. Funciones.
IX. Control del flujo.
X. Uso de R para generación de gráficos científicos.
XI. Generación de reportes.
XII. Bioconductor para análisis de datos transcriptómicos.
XII.I Análisis de Transcriptomas para identificar genes diferencialmente expresados.
XII.II. Creación de Heatmaps.
Evaluación y acreditación:
Asistencia: 80%
Presentación de un Proyecto Final: 20%
Bibliografía:
www.r-project.org
Zhong Wang, Mark Gerstein, and Michael Snyder. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nature Reviews Genetics. 2009. 10(1): 57–63.
Darren J. Burgess. Putting transcriptomics in its place. Nature Reviews Genetics. 2015. 16(319).
Informes técnicos:
Dr. Mario Alberto Arteaga Vázquez
maarteaga@uv.mx
Teléfono 01(228) 842 1700 Ext. 10854
Informes administrativos:
L.C. Norma Mendoza López
nmendoza@uv.mx
Teléfono 01(228) 842 1700 Ext. 10857
* "La Universidad Veracruzana se reserva el derecho de cancelar o posponer el presente programa, si no se cubre el cupo mínimo requerido."
** "Curso registrado y autorizado por la Universidad Veracruzana a través del Departamento de Educación Continua de la Dirección General de Desarrollo Académico e Innovación Educativa con clave CEC-312-16"
