Con el propósito de conocer la situación real en que se encuentra el INBIOTECA en el área de Vinculación (situación externa), los académicos utilizaron el análisis "FODA" para examinar la situación externa y su relación con las características internas para el PLADEA 2009-2012. Así, la discusión colegiada permitió dilucidar que al combinar fortalezas-oportunidades surgieron las potencialidades (acciones prometedoras) y al combinar las debilidades-amenazas se generaron las limitaciones (advertencias) sobre el derrotero que deberá asumir el INBIOTECA en un futuro para contribuir en el desarrollo y bienestar social de Veracruz y del país: 1) educación de posgrado innovador y crítico, 2) generación de ciencia y tecnología relevante y pertinente, 3) seguridad alimentaria y 4) cuidado y manejo del entorno (servicios ambientales y recursos naturales).
En sus primeros 6 años el INBIOTECA ha establecido colaboración de trabajo con grupos de productores del estado de Veracruz, Chiapas y Yucatán. Tiene relaciones con investigadores de la UNAM, INECOL, CICY, Colegio de Postgraduados de los Campus Veracruz y Tabasco, Macquarie University-Australia, Ashoka Trust for Research in Ecology and the Environment (ATREE), India, Universidad de Santiago de Compostela, Centro Iberoamericano de Biodiversidad (CIBIO) de la Universidad de Alicante-España, EMBRAPA Florestas (Brasil), y con asociaciones civiles (como la Unión de Silvicultores de Coatepec, SENDAS, Grupo de Mujeres del ejido El Conejo). Ha gestionado apoyos económicos con CONACYT, COVECYT, CONABIO, CONAFOR, CONANP y PROMEP. Estos vínculos fortalecen nuestro quehacer científico puesto que los conocimientos y tecnología desarrollada por nuestros académicos aportarán soluciones a problemas tan variados como el control de plagas en cítricos, plátano, papaya, y otros; mejoras en la productividad del cultivo del chile habanero, de viveros forestales, de cultivos agrícolas mediante el manejo de la fertilidad del suelo; así como a fomentar la conservación mediante la aportación de servicios ambientales (carbono, biodiversidad y agua) del Cofre de Perote y de la Cuenca del río Pixquiac, entre otros.
El INBIOTECA como entidad académica de reciente creación ha ubicado su quehacer científico en investigaciones que respondan a las necesidades de los sectores productivos (agrícolas y forestales) y de la conservación de los recursos naturales. No obstante, reconoce que es necesario contar con diagnósticos sistemáticos, que le permita identificar con mayor precisión temas prioritarios en los cuales enfocar su quehacer científico, e impulsar vínculos más directos con productores, empresas y organizaciones de la sociedad involucradas en estos temas. A través de estas acciones sus Cuerpos Académicos pueden retroalimentar las temáticas de investigación en las que se enfocan, así como identificar las áreas de transferencia de tecnología y de difusión del conocimiento generado en este instituto.