Se enlistan a continuación los investigadores y las líneas de investigación que cultivan.
- Dr. José Antolín Áke Castillo (Plancton y productores primarios)
- Dr. Virgilio Eugenio Arenas Fuentes (Interacciones entre ecología y las pesquerías)
- Dr. Javier Bello Pineda (Análisis espacial para toma de decisiones)
- Dra. Gabriela Galindo Cortes (Pesquerías)
- Dr. Alejandro Granados Barba (Ecología de ambientes costeros)
- Dra. María de Lourdes Jiménez Badillo (Análisis de pesquerías)
- Dr. Cesar Gabriel Meiners Mandujano (Análisis de pesquerías y variables ambientales)
- Dr. Mark Marín Hernández (Oceanografía física)
- Dr. Yuri Okolodkov (Taxonomía, ecología y biogeografía de microalgas)
- Dr. Leonardo Ortiz Lozano (Estrategias para el manejo de recursos en zonas costeras)
- Dr. Héctor Perales Valdivia (Oceanografía física de estuarios y lagunas costeras)
- Dr. David Salas Monreal (Oceanografía física, biofísica marina y modelación)
- Dra. Rosario Sanay González (Dinámica costera)
- Dr. Horacio Pérez España (Ecosistemas de arrecifes)
- Dra. María Enriqueta Velarde González (Ecología de aves marinas y costeras)
- Dra. Gabriela Athié de Velasco (Oceanografía física de mesoescala)
