S	Actividad académica	Horas			Créditos
		Teoría	Práctica	Total	Teoría	Práctica	Total
1º	Asignatura Optativa I Asignatura Optativa II Trabajo de Investigación I	30 30 90	15 15 0	45 45 90	4 4 12	1 1 0	5 5 12
2º	Trabajo de Investigación II Estancia de Investigación I Ayudantía en Investigación y Docencia I	90 0 45	0 90 0	90 90 45	12 0 6	0 6 0	12 6 6
3º	Trabajo de Investigación III Estancia de Investigación II Ayudantía en Investigación y Docencia II	90 0 45	0 90 0	90 90 45	12 0 6	0 6 0	12 6 6
4º	Trabajo de Investigación IV Estancia de Investigación III Ayudantía en Investigación y Docencia III	90 0 45	0 90 0	90 90 45	12 0 6	0 6 0	12 6 6
5º	Trabajo de Investigación V Estancia de Investigación IV Actividades Complementarias I	90 0 45	0 90 0	90 90 45	12 0 6	0 6 0	12 6 6
6º	Trabajo de Investigación VI Estancia de Investigación V Actividades Complementarias II	90 0 45	0 90 0	90 90 45	12 0 6	0 6 0	12 6 6
7º	Trabajo de Investigación VII Actividades Complementarias III Artículo en publicación nacional indexada I	90 45 45	0 0 0	90 45 45	12 6 6	0 0 0	12 6 6
8º	Trabajo de Investigación VIII Artículo en publicación internacional indexada I Redacción y Elaboración de Tesis Doctoral	90 90 45	0 0 0	90 90 45	12 12 6	0 0 0	12    12     6
	Total	1230	480	1710	164	32	196

S = Semestre

El programa contempla la presentación de un Examen Predoctoral, dos Asignaturas Optativas, ocho Trabajos de Investigación, cinco Estancias de Investigación, tres Actividades Complementarias, tres Ayudantías en Investigación y Docencia y la publicación o aceptación de un artículo científico en una revista de circulación nacional y otro en revista de circulación internacional. Ambas en revistas indexadas. Todo lo cual deberá cubrirse en el lapso de tres años, incluida la Tesis Doctoral terminada.

El Examen Predoctoral deberá presentarse en el transcurso de los primeros cuatro semestres y consistirá en una evaluación de los conocimientos generales del alumno. El Comité Tutoral sugerirá al alumno las Asignaturas Optativas que deberá cursar de entre las asignaturas que se ofrecen en el Programa. En caso de ser necesario y por recomendación del propio Comité, el alumno podrá tomar Cursos Extracurriculares en la misma institución u otra nacional o extranjera, a fin de subsanar deficiencias en alguna materia en particular o por necesidades de especialización en su tema de tesis.

El Trabajo de Investigación I corresponde a la completa definición del proyecto de investigación que realizará el alumno, mismo que deberá ser acordado con su Comité Tutoral.

Los Trabajos de Investigación II a V consistirán en la evaluación de los avances del proyecto de investigación, que deberán mostrar un avance sustantivo en cada ocasión, de manera tal que con la información generada hasta el penúltimo trabajo de investigación, se elabore un artículo científico para someterlo a una revista de circulación nacional. Como culminación del Trabajo de Investigación VI, el alumno elaborará un artículo científico y lo someterá a una revista de circulación internacional. Estos Trabajos de Investigación deberán ser presentados semestralmente ante el Seminario del Posgrado en Ecología y Pesquerías, quién determinará el 50 % de la evaluación. El 50 % restante será otorgado por el Comité Tutoral.

Las Estancias de Investigación tienen la finalidad de ser el medio para que el alumno realice los trabajos de campo o laboratorio pertinentes, necesarios para lograr con éxito el cumplimiento de los objetivos de su proyecto de investigación. Estas estancias pueden realizarse en cualquier institución nacional o extranjera dependiendo de las necesidades del proyecto y puede ser tan dinámica como el propio alumno lo requiera.

Las Ayudantías en Investigación y Docencia se realizarán bajo la supervisión de un profesor responsable integrante del Cuerpo Académico del Posgrado y consistirán en apoyar las sesiones de impartición de alguna asignatura relacionada con la línea de investigación del estudiante o bien apoyar las tareas de investigación del profesor responsable. Esta modalidad tiene la finalidad de ir involucrando al alumno en la docencia formal y en el proceso de generación de investigación de frontera, a la vez que sirve de apoyo a los profesores externos, quienes encuentran en el ayudante una vía para continuar realizando actividades académicas con el grupo de alumnos, en períodos fuera de los designados para que el profesor externo acuda a la sede del Posgrado a impartir su asignatura. La designación de las ayudantías será establecida en Reunión de Consejo Académico, para lo cuál tanto alumnos como profesores deberán realizar su solicitud por escrito, fundamentando su petición en intereses académicos e indicando los beneficios para el ayudante, el profesor y los alumnos.

Durante el desarrollo de la investigación, el alumno deberá realizar la presentación de sus avances en Foros Científicos tales como Congresos, Simposios, Reuniones Científicas, Conferencias, etc. por invitación expresa, que serán consideradas como Actividades Complementarias. Estas contribuirán a fomentar la correcta comunicación de sus resultados a la vez que permitirán fomentar el intercambio de experiencias, establecer futuras colaboraciones y serán un medio de actualización para el alumno.

Como culminación de sus estudios de doctorado, el alumno deberá realizar la defensa oral de su proyecto de investigación ante el jurado designado para tal fin, lo que lo conducirá a la obtención del grado en caso de que la defensa sea satisfactoria.