El horizonte laboral del egresado de la Maestría y Doctorado en Ecología y Pesquerías, puede permitir que los egresados se incorporen a:

• La investigación y el desarrollo científico y tecnológico en el área  desempeñándose como investigador activo e institucional.
• La aplicación de sus conocimientos en la solución de problemas en los sectores productivos, de servicios y gubernamentales.
• El ejercicio de la docencia en los niveles de licenciatura, especialización, maestría y doctorado, así como en instituciones de producción y de servicio, en programas de formación y capacitación de personal de alto nivel y programas de divulgación.
• La asesoría y gestión en la toma de decisiones garantizando transparencia y análisis de incertidumbre y riesgo con una visión multidisciplinaria.
• La asesoría y gestión a organizaciones no gubernamentales orientadas al desarrollo social y la conservación de la naturaleza.
• La gestión empresarial en ecoturismo, maricultura, acuarismo, biotecnología, turismo científico.