Dr. Miguel Ángel Jiménez Montaño
Codigos Correctores De Errores En Biologia Molecular Correcting Codes in Molecular Biology
SEP-2003-CO2_44625
Dr. Miguel Ángel Jiménez Montaño
SNI Nivel II
Descripción General Del Proyecto
El objetivo central de este proyecto es extender estudios previos sobre la forma de la redundancia, su sustento físico-químico y su papel en la evolución molecular, a través del análisis del código genético y sus variantes. Cuantificar la influencia de las mutaciones conservativas y neutrales en la viabilidad y evolución proteínas de diversas familias. Analizaremos las mutaciones neutrales en los dominios SH2 y Sh3 y en las regiones hipervariables de las inmunoglobulinas empleando nuestro enfoque teórico y las herramientas computacionales que hemos desarrollado para analizar secuencias (WinGramm) y que estamos desarrollando, como HypeGCode, que es un paquete de programas interactivo para representar al código en 6 dimensiones, los aminoácidos, sus propiedades físico-químicas y las trayectorias de mutación , a partir de un alineamiento de secuencias de ADN, ARN, o proteínas de una familia.
| Click on the image to download | Description |
WinGramm 1.7 |
A Gramatical Complexity Analisys tool |
| WinGramm 2.0 | Comming Soon |
HyperGCode |
A 6D Boolean Representation of the Genetic Code Tool |
HyperGCode |
A 6D Boolean Representation of the Genetic Code Tool Version 2.1 |
| HyperGCodeWeb
V 1.0 |
Coming Soon |
| SimProt | Coming Soon |
CURRICULUM VITAE
Fecha------------------------------26 de Febrero de 2008
Nombre:-------------------------- Miguel Ángel Jiménez Montaño
Idiomas:-------------------------- Lee, habla y escribe Inglés, habla Polaco, lee y escribe Francés.
DATOS LABORALES:
Nombre del cargo que ocupa:-- Profesor e investigador de tiempo Completo, Titular “C”
Lugar de trabajo:----------------- Universidad Veracruzana
Departamento:-------------------- Facultad de Física e Inteligencia Artificial
Domicilio laboral:---------------- Sebastián Camacho # 5, Colonia Centro
91090 Xalapa, Ver.
Teléfono Oficina:--------------- (228) 8 17 2957
Fax:------------------------------- (228) 8 17 2855
CARGOS ACADÉMICOS DESEMPEÑADOS:
Profesor de física en la preparatoria de los colegios "Madrid" e "Israelita de México". 1963 y 1964.
Profesor de física de la Facultad de Ciencias de la Universidad Veracruzana. Febrero de 1965 - Agosto de 1968; Septiembre de 1969- Agosto de 1972.
Asistente de Profesor: Universidad de Wisconsin, Departamento de Física; Verano de 1968. Universidad de Colorado, Departamento de Ciencias Aeroespaciales; Verano de 1969.
Investigador de Tiempo Completo, Universidad Veracruzana, Instituto de Ciencias Básicas de Julio 1976 a Julio 1982
Profesor Titular del Departamento de Física y Matemáticas de la UDLA-P. 1º Agosto 1991- abril 2001.
Licenciatura: 79 cursos a nivel de licenciatura, impartidos en diferentes instituciones, incluyendo: biofísica, biomatemáticas, métodos computacionales en biología molecular, física teórica, mecánica cuántica, mecánica estadística, termodinámica, electromagnetismo, biofísica molecular, biología molecular, probabilidad y estadística etc.
Maestría: 9 cursos en la Maestría de Inteligencia Artificial.
CARGOS ADMINISTRATIVOS DESEMPEÑADOS:
Investigador de Tiempo Completo y responsable del proyecto de investigación FENÓMENOS COLECTIVOS EN SISTEMAS BIOFÍSICOS Y SOCIO-ECONÓMICOS, en el Instituto de Ciencias Básicas de la Universidad Veracruzana. Julio de 1976 - Julio de 1982.
Investigador de Tiempo Completo y responsable del proyecto de investigación: APLICACIÓN DEL MÉTODO SINTÁCTICO EN EL RECONOCIMIENTO Y GENERACIÓN DE PATRONES EN BIOLOGÍA MOLECULAR. Instituto de Ciencias Básicas de la Universidad Veracruzana. Julio de 1983 - Diciembre de 1986.
Investigador de Tiempo Completo y responsable de proyecto de investigación MÉTODOS COMPUTACIONALES EN BIOLOGÍA MOLECULAR: APLICACIONES A INMUNOGLOBULINAS Y ARN VIRALES en el Centro de Investigaciones Biológicas la Universidad Veracruzana. y en el Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno, UNAM: Enero 1987 a Agosto 1990.
Investigador de Tiempo Completo y responsable de proyecto de investigación ANÁLISIS SINTÁCTICO DEL LENGUAJE GENÉTICO A NIVEL DE ADN Y A NIVEL DE ARN, en el Instituto de Estudios Avanzados, UDLA-P . Septiembre de 1990- Junio de 1992.
Investigador de Tiempo Completo y responsable de proyecto de investigación internacional: SINTAXIS, COMPLEJIDAD Y EVOLUCIÓN DE BIOSECUENCIAS en el Instituto de Investigación y Postgrado, UDLA-P y en la Universidad Humboldt de Berlín. Junio de 1993- Mayo de 1994 y Junio de 1996- Mayo de 1998.
Investigador de Tiempo Completo y responsable del Proyecto de Investigación Internacional : ESTRUCTURA Y EVOLUCIÓN DEL CÓDIGO GENÉTICO, en el Instituto de Investigación y Postgrado, UDLA-P. Diciembre de 1999-Noviembre de 2001
Investigador de Tiempo Completo y responsable del Proyecto de Investigación Internacional : CÓDIGOS CORRECTORES DE ERRORES EN BIOLOGÍA MOLECULAR (SEP-2003-C02-44625) en la Facultad de Física e Inteligencia Artificial de la Universidad Veracruzana. Junio de 2004- junio de 2006.
Coordinador de Investigación y Postgrado de la Escuela de Ciencias en el Instituto de Investigación y Postgrado de la UDLA. 1995-1997.
FORMACIÓN ACADÉMICA:
Licenciatura: Universidad Nacional Autónoma México;
Licenciatura en Física
29 de agosto de 1967.
MAESTRÍA:
Universidad de Wisconsin,
Maestría en Ciencias (Física)
9 de junio de 1969.
DOCTORADO:
Universidad N. Copérnico, Polonia;
Doctor en Ciencias (Física Estadística)
14 de enero de 1976
OTROS ESTUDIOS:
Introducción a la Teoría General de la Relatividad;
Observaciones Cosmológicas,
Cursos de Verano, U. de Colorado; 1969
Electrodinámica Cuántica, Simetrías en Física
de Partículas Elementales. Cursos de Verano,
CINVESTAV; 1970.
Estructura Macromolecular; semestre de Primavera,
Universidad de California, San Francisco; 1983.
Post-Doctorado en Biofísica Molecular, Universidad
de California, San Francisco.
Agosto de 1982-Junio de 1983
NIVEL EN EL S.N.I.
Nivel II
Área de la ciencia: Física
Disciplina: Biofísica
Especialidad: Biofísica molecular computacional
Formación de recursos humanos:
TESIS DIRIGIDAS
Nombre del estudiante: Rusalky Del Angel Ortíz
Programa al que pertenece: Maestría en Inteligencia Artificial
Título de la tesis: Aplicaciones de la Inteligencia Artificial en Bioinformática
Fecha del examen: Enero 26 2007
Nombre del estudiante: Héctor Rafael Lucio García
Programa al que pertenece: Maestría en Inteligencia Artificial
Título de la tesis: Códigos Correctores de Errores y Compactación de Secuencias: Aplicaciones en Bioinformática
Fecha del examen: Octubre 31 2006
Nombre del estudiante: Balder Arturo Villagómez Bernabe
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Análisis Termodinámico y Estadístico de la Estabilidad y Fluctuaciones de las Proteínas
Fecha del examen: Septiembre 2006
Nombre del estudiante: Emmanuel Estrada Almazán
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Monografía Didáctica de Simulación sobre Sistemas de Osciladores Lineales y no Lineales
Fecha del examen: Enero 2005
Nombre del estudiante: Enedino Hernández Torres
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Estudio Teórico y Simulación Computacional de las Vibraciones de la Membrana Timpánica
Fecha del examen: Junio 2004 (Asesor interno)
Nombre del estudiante: Fidel Córdoba Valdés
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Ejemplo de un Motor Molecular
Fecha del examen: Agosto 21 2003
Nombre del estudiante: Julio César Sandria Reynoso
Programa al que pertenece: Maestría en Inteligencia Artificial
Título de la tesis: Aplicaciones de la Inteligencia Artificial al Análisis de Secuencias de Proteínas
Fecha del examen: Agosto 29 2003
Nombre del estudiante: Jorge Moisés Trejo Vargas
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Medidas de variabilidad de secuencias de aminoácidos en la evolución molecular
Fecha del examen: Junio 2001
Nombre del estudiante: María de los Ángeles Reigosa Pardavila
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Método de digitalización de secuencias y su aplicación al análisis de señales nerviosas
Fecha del examen: Junio 2001
Nombre del estudiante: Nicolas Brunet
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Robustez e hidrofobicidad: factores determinantes en la evolución del código genético
Fecha del examen: Abril 2001
Nombre del estudiante: Elizabeth Villa Rodríguez
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Propiedades fisicoquímicas y grupos funcionales de los aminoácidos en las regiones hipervariables de las inmunoglobulinas
Fecha del examen: Enero 2001
Nombre del estudiante: Alejandro Morales Gallardo
Programa al que pertenece: Licenciatura en Física
Título de la tesis: Medidas de complejidad y su aplicación al estudio de biosecuencias
Fecha del examen: Enero 2001
Nombre del estudiante: Edwin Culp Morando
Programa al que pertenece: Licenciatura en Química
Título de la tesis: Análisis de proteínas como secuencias de aminoácidos codificados
Fecha del examen: Enero 2001
Nombre del estudiante: Héctor Luis Penagos Vargas
Grado obtenido: Licenciado en Física
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Análisis de señales nerviosas por métodos informacionales y algorítmicos
Fecha del examen: Mayo de 2000
Nombre del estudiante: Ángel Hernández Torres
Grado obtenido: Licenciado en Física
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Algoritmo genético para simular la evolución de macromoléculas conservando las propiedades fisicoquímicas de los monómeros.
Fecha del examen: Otoño de 1999
Nombre del estudiante: Margarita Lissete Ponce Guarneros
Grado obtenido: Licenciada en Actuaría
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Estudio de la productividad científica de los investigadores de la Universidad de las Américas-Puebla
Fecha del examen: Verano de 1998
Nombre del estudiante: Andrés Díaz Ruiz
Grado obtenido: Licenciado en Actuaría
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Estudio de la difusión y distribución de la productividad científica en el área de los semiconductores
Fecha del examen: Primavera de 1998
Nombre del estudiante: Samuel Antonio García Rosas
Grado obtenido: Licenciado en Actuaría
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Estudio sobre la distribución del ingreso
Fecha del examen: Primavera de 1998
Nombre del estudiante: Miguel Angel Hernández Morales
Grado obtenido: Licenciado en ingeniería en sistemas computacionales
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Sistema para el análisis de Biosecuencias: herramientas para el cálculo de medidas de complejidad de secuencias biológicas.
Fecha del examen: Verano de 1998
Nombre del estudiante: Carlos Enrique Ibarra Cantú
Grado obtenido: Licenciado en Física
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Modelaje del cambio incremental en la innovación tecnológica por un
Proceso de Weibull
Fecha del examen: 1998
Nombre del estudiante: Hugo Peláez Espinosa
Grado obtenido: licenciado en Economía
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Un modelo de distribución de ingreso
Fecha del examen: Primavera de 1996
Nombre del estudiante: Leticia Solís Girón
Grado obtenido: Licenciada en ingeniería en Sistemas Computacionales
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Biosyntax: Análisis sintáctico de Biosecuencias
Fecha del examen: Primavera de 1995
Nombre del estudiante: Enrique Amavizca Ruiz
Grado obtenido: Licenciatura en Ingeniería en sistemas computacionales
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Genesys: Herramienta para el análisis físico-químico del código genético
Fecha del examen: Primavera de 1995
Nombre del estudiante: Enrique Edgar I. Benitez Guerrero
Grado obtenido: Licenciatura en Ingeniería en sistemas computacionales
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Algoritmos de inferencia inductiva del tipo ID3 y algunas aplicaciones en
El análisis de biosecuencias
Fecha del examen: Primavera de 1993
Nombre del estudiante: Pedro Cerón Navarrete
Grado obtenido: Licenciatura en Ingeniería en sistemas computacionales
Institución: Universidad de las Américas-Puebla
Título de la tesis: Algoritmos de inferencia inductiva del tipo ID3 y algunas aplicaciones en
El análisis de biosecuencias
Fecha del examen: Primavera de 1993
Nombre del estudiante: Carlos Rubén de la Mora Basañez
Grado obtenido: Maestría en Ciencias con opción en Matemáticas Aplicadas
Institución: Universidad Veracruzana
Título de la tesis: Modelo de evolución molecular de seis parámetros
Fecha del examen: 1992
Nombre del estudiante: Maricela Quintana López
Grado obtenido: Maestría en ciencias computacionales
Institución: Instituto Tecnológico y de estudios superiores de Monterrey, Campus Edo. de México
Título de la tesis: Análisis sintáctico de Biosecuencias
Fecha del examen: Julio de 1993
Nombre del estudiante: Pedro Carmona González
Grado obtenido: Licenciado en Física
Institución: Universidad Veracruzana
Título de la tesis: Acerca de la entropía de mezcla de gases semejantes.
Fecha del examen: 1972
PRODUCCIÓN CIENTÍFICA:
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ARTÍCULOS DE DIVULGACIÓN:
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Sobre el Lenguaje Genético, el Habla y la Evolución Biológica. Revista Información Científica y Tecnológica. Vol 17. No. 226 Julio-Agosto de 1995 pp 25-32. (2o. Premio del Primer Concurso de Divulgación Escrita en Temas de Frontera, SOMEDICYT, CONACYT, UNAM).
Sobre lo Posible, Los Lenguajes de la Vida y Otras Cosas. Revista Ciencia y Desarrollo. Vol. 18, Enero/Febrero de 1993.pp 16-23 (1er. Premio de Ensayo en el Concurso Nacional de Divulgación Científica organizado por el Corredor Cultural Universitario Centro Oriente y ANUIES).
Ciencia y Humanismo: Las 2 caras de Jano, Revista La ciencia y el Hombre, Vol. 11: 5-6 (editorial), Mayo/Agosto de 1992.
El Departamento de Física y Matemáticas de la UDLA (con O. Alarcón y M.A. Rosales). Boletín de la sociedad Mexicana de Física. Vol.6.:61-63. Mayo/Agosto de 1992.
La Ecología del Pensamiento y el Problema Educativo. Revista Extensión No.31, Xalapa, 1989, 4 Páginas.
La Ley de Entropía en México (carta al editor), Revista Ciencia y Desarrollo. No. 19 , marzo-abril 1978. pp 4-5.
Las Bases Físicas de la Autoorganización de la Materia, las Estructuras Disipativas y la Evolución. Revista Ciencia y Desarrollo. No. 21, julio-agosto 1978. pp 63-70.
Nuestros Modelos del Universo. Revista Física. Vol.2, no. 3, 11-17. abril 1970.
CONTRATOS, PROYECTOS Y SUBVENCIONES PARA LA INVESTIGACIÓN
ENSEÑANZA E INVESTIGACIÓN SOBRE FENÓMENOS COLECTIVOS EN SISTEMAS BIOQUIMICOS Y SOCIO-ECONÓMICOS. (PCAINAL-790360) Julio de 1976 - Julio de 1982.
APLICACIÓN DEL MÉTODO SINTÁCTICO EN EL RECONOCIMIENTO Y GENERACIÓN DE PATRONES EN BIOLOGÍA MOLECULAR. Julio de 1983 - Diciembre de 1986.
MÉTODOS COMPUTACIONALES EN BIOLOGÍA MOLECULAR: APLICACIONES A INMUNOGLOBULINAS Y ARN VIRALES (Convenio SEP C89-01-007, anexo 1) Enero de 1987 - Agosto de 1990.
ANÁLISIS SINTÁCTICO DEL LENGUAJE GENÉTICO A NIVEL DE ADN Y A NIVEL DE ARN. IDEA, UDLA . Septiembre de 1990-Junio de 1992.
SINTAXIS, COMPLEJIDAD Y DINÁMICA DE BIOSECUENCIAS. IDEA, UDLA. Julio - Diciembre de 1992.
Responsable del Proyecto de Investigación Internacional (CONACYT:1932-E9211) SINTAXIS, COMPLEJIDAD Y EVOLUCIÓN DE BIOSECUENCIAS. IDEA /UDLA, Universidad Humboldt de Berlín, Wayne State University, Pennsylvania Medical School, ITESM/CEM, Instituto de Química, UNAM y Universidad Veracruzana. Junio de 1993- Mayo de 1994.
Responsable del Proyecto de Investigación Internacional (CONACYT:2621P-E): SINTAXIS, COMPLEJIDAD Y EVOLUCION DE BIOSECUENCIAS (continuación del proyecto anterior). INIP /UDLA, Universidad Humboldt de Berlín,, Pennsylvania Medical School y Universidad Veracruzana. Junio de 1996- Mayo de 1998.
Co-Responsable del Proyecto de Investigación (CONACYT: 25977-A): MODELAJE Y CARACTERIZACIÓN DE PATRONES EN LAS CIENCIAS BIOLÓGICAS Y DEL COMPORTAMIENTO POR MÉTODOS COMPUTACIONALES. En colaboración con la Maestría en Inteligencia Artificial de la Universidad Veracruzana. Julio de 1998- Junio de 2000.
Responsable del Proyecto de Investigación Internacional (CONACYT: 32201-E): ESTRUCTURA Y EVOLUCIÓN DEL CÓDIGO GENÉTICO. En colaboración con la Universidad Humboldt de Berlín. Diciembre de 1999-Noviembre de 2001
Responsable del Proyecto de Investigación Internacional (SEP-2003-C02-44625): CÓDIGOS CORRECTORES DE ERRORES EN BIOLOGÍA MOLECULAR. En colaboración con la Universidad Humboldt de Berlin. Junio de 2004-2006.
CONGRESOS Y SEMINARIOS INTERNACIONALES
VII International Biophysics Congress
Evolutionary Model for the Generation of Amino Acid Sequences and its Application to the Study of Fragments of Mammal -Hemoglobin Chains.
International Union of Pure and Applied Biophysics México, D.F. 23-28 de Agosto de 1981.
I Waddington Conference Formal Languages and Theoretical Molecular Biology Centro de Investigación Sobre Fijación de Nitrógeno, UNAM Oaxtepec, Morelos 23-27 de Septiembre de 1987.
IV International Conference on Irreversible Processes and Selforganization Pattern Recognition, Molecular Sequence Analysis and Biological Information. Wilhelm-Pieck-Universitat , Rostock, DDR. 20 -24 de Febrero de 1989.
III Osaka Group Meeting. Aminoacid Distribution of Specificity Determining Positions of Inmunoglobulins. Oaxtepec, Mor.(with F. Lara-Ochoa and E. Vargas-Madrazo) 15-19 de Abril de 1991.
Structure and Dynamics of DNA Genetic Code Linguistics Oaxtepec, Mor. 8 al 12 de Julio de 1991.
Society for Mathematical Biology Annual Meeting Six-Dimensional Representation of the Genetic Code Santa Fe Institute, Santa Fe, New Mexico 18-21 de Agosto de 1991
III Waddington Conference Statistical Identification of Antigen Recognition Sites in Immunoglobulins (with F. Lara-Ochoa and E. Vargas-Madrazo). Santa Fe Institute, Santa Fe, New Mexico 13 al 17 de Mayo de 1992.
Society for Mathematical Biology Annual Meeting. Genetic Code Structure and Codon Substitutions in homologous DNA sequences. (with R. de la Mora-Basañez) University of California at Berkeley. Julio 23-26 de 1992.
Society for Mathematical Biology Annual Meeting. The Genetic code as a six-dimensional boolean hypercube. (with R. de la Mora-Basañez) University of California at Berkeley. Julio 23-26 de 1992.
Society for Mathematical Biology Annual Meeting. A skew distribution of the recognition sites of the hypervarible region of inmunoglobulins. (with F. Lara-Ochoa and E. Vargas-Madrazo) University of California at Berkeley. Julio 23-26 de 1992.
New Developments in Technology Studies: Evolutionary Economics and Chaos Theory. Hyperselection and Innovation Described by a Stochastic Model of Technological Evolution (with: E. Bruckner, W. Ebeling and A. Scharnhorst) University of Amsterdam., Amsterdam. Mayo 6-8 de 1993.
North-German Bioinformatics Meeting at Castle Luebbenau On Grammar, Entropy and Complexity of Biomolecules (with W. Ebeling) Lubbenau, Germany. 10 - 13 de Octubre de 1993
The 6th Workshop Open Systems and Information Dynamics On Grammar, Entropy and Complexity of Biomolecules and Human Writings (with W. Ebeling and T. Pöschel) Institute of Physics, Nicholas Copernicus University Torun, Poland. 5-9 abril 1994.
The Third International Conference of Bioinformatics and Genome Research 1. On the Hypercube Structure of the Genetic Code (with T. Pöschel and C.R. de la Mora-Basañez). 2. Rapid Calculation of Block Entropies of Large Data Samples (with W. Ebeling and T. Pöschel) Tallahasse, Florida, USA. 1-4 junio 1994.
Complex Systems and Binary Networks (The Guanajuato Lectures). SYNTAX: A Computer Program to Compress a Sequence and to Estimate its Information Content (with W. Ebeling and T. Pöschel). Guanajuato, Gto. México. 16-22 enero 1995.
Society for Mathematical Biology, International Meeting. The Hypercube Structure of the Genetic Code and Sexual PCR Oaxtepec. Mor. México. 27-31 mayo 1995.
Self-Organization of Complex Structures: From Individual to Collective Dynamics. Dynamics of Innovations in Technology and Science-Including Individual Development (with W. Ebeling and Karmeshu). Berlin, Germany. 24-28 Septiembre de 1995.
North-South America Conference on Biotechnology GENESYS: A Computational Tool for the Analysis and Design of DNA Schuffling and REM Experiments (with E. Amavizca-Ruiz). Cuernavaca, Mor. 26-29 Noviembre de 1995.
Simposio sobre Complejidad en Biología A Measure of the Information Content of Neural Spike Trains (with T. Pöschel and Paul E. Rapp) Montevideo, Uruguay. Ponencia por invitación. 12-14 Diciembre de 1995..
2nd. Congress of the Americas Plenary Panel 2: Education in Basic and Applied Sciences and Engineering (discussant). Puebla, Pue. Mex. 27-28 Febrero, 1º. Marzo 1997.
México / U. S. Workshop on Teaching Freshman Physics Modeling of Physical and Non-physical Systems Monterrey, Nuevo León, México. 24-25 Octubre 1997.
Komplexe Systeme und Nichtlineare Dynamik in Natur und gesellschaft. Nichtlineare Dynamik von Innovationen in Wissenschaft und Technologie (with W. Ebeling, A. Scharnhorst and Karmeshu) Reigensburg, Germany. 16-18 Octubre 1997.
Workshop: Agents, Trajectories, Landscapes-Innovation processes in Science, Technology & Economy. Modeling of the Incremental Change in Technological Innovation by a Weibull Process (with C.E: Ibarra-Cantú). Institut für Physik, Humboldt-Universität zu Berlin. Berlin, Germany. 25 Noviembre 1998.
Worshop of the graduate programme “Dynamics and Evolution of Cellular and Macromolecular processes” The genetic code: Its physical bases and evolutionary origin Hiddensee, Germany. Ponencia por invitación 17-19 Marzo 1999.
RECOMB’99 Hypergene: An interactive 6-dimensional representation of the genetic code (with C. R. De la Mora-Basañez). Lyon, France. 11-14 Abril 1999.
Seventh International Conference on Scientometrics and Informetrics Diffusion and distribution of scientific productivity in the area of semiconductors (with A. Díaz Ruiz , C.E. Ibarra-Cantú) Colima, México. 5-9 Julio 1999.
The 3rd International Workshop on Neuronal Coding '99 in Osaka Measures of complexity in neural spike trains of the slowly adapting stretch receptor organs (with O. D. Martinez, G. R. Riquer & A. H. Torres), Osaka, Japón, 10-15 Octubre 1999.
XX Congreso Latinoamericano de Ciencias Fisiológicas y XLII Congreso Nacional de Ciencias Fisiológicas. Análisis de trenes de espigas neuronales por métodos informacionales y algorítmicos. (con O. Diez-Martínez, H. Penagos, A. Hernández-Torres) Cancún, México. 3- 7 Septiembre 2000.
Heraeus-Summer School Entropy and Complexity: Analysis of Symbolic Sequences. (with R. Steuer, L. Molgedey and W. Ebeling). Chemnitz, Alemania. 15-30 Septiembre 2000
XI Annual International Conference of the Society for Chaos Theory in Psychology & Life Sciences. On the coding of information with finite pseudorandom sequences: Its measures and interpretation (con Rainer Feistel, M.A. reigosa-Pardavila, J.M: Trejo-Vargas, O. Diez-Martínez) Madison, Wis. 3-6 Agosto 2001.
International Conference on Bioinformatics and its Applications (ICBA’04) Applications of Hyper Genetic Code to Bioinformatics Nova Southeastern University, Fort Lauderdale, Florida, USA 16-19 Diciembre 2004.
CONGRESOS NACIONALES:
Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Física. Un estudio de la Difracción y Polarización de los electrones por medio de la ecuación de Dirac. Mayo de 1970. Xalapa, Veracruz.
I Congreso de Biología Teórica y Química Biológica. Un procedimiento para caracterizar la estructura común de una familia de proteínas. Coordinación de Investigación Científica, UNAM. Abril de 1984. Cuernavaca, Morelos.
I Taller de Procesos Estocásticos. Acerca del Principio de Maximización de Entropía de Jaynes. Instituto de Ciencias Básicas, U.V., Mayo de 1985.
I Congreso Nacional de Biología Teórica. Citocromo C y Globinas: ¿Evolución convergente o divergente? UNAM. Diciembre de 1985. México D.F.
II Congreso Nacional de Biología Teórica. Secuencias Repetidas y el Origen de la Formación Genética. Coordinación de la Investigación Científica de la UNAM. Cuernavaca Morelos. Diciembre de 1986.
XVI Congreso Nacional de Bioquímica. Caracterización de las Globinas por medio de Gramáticas Formales. Universidad Veracruzana, Xalapa, Ver. Noviembre de 1986.
I Coloquio de Lingüística "Mauricio Swadesh". Sobre la Lingüística estructural y el lenguaje genético. Instituto de Investigaciones Antropológicas, UNAM. Octubre de 1987.
XX Congreso Nacional de la Sociedad Matemática Mexicana. Principio de optimización para la caracterización de elementos primitivos en el reconocimiento sintáctico de los patrones. Facultad de Matemáticas, Universidad Veracruzana. Noviembre de 1987.
III Congreso Nacional de Biología Teórica. Clasificación Sintáctica de Codones y el Concepto de Gradualismo. UNAM, Cuernavaca, Morelos. Del 4 - 6 de Diciembre de 1989
III Congreso Nacional de Biología Teórica. Estudio Estadístico de la Variabilidad de los Aminoácidos en las Inmunoglobulinas. UNAM, Cuernavaca, Morelos. Del 4 - 6 de Diciembre de 1989
II Coloquio "Mauricio Swadesh". Estructura Sintáctica y Evolución del Código Genético Instituto de Investigaciones Antropológicas, UNAM 1 al 6 de Octubre de 1990.
III Congreso Regional de Investigación y Enseñanza de la Física. El Código Genético y las Restricciones Estructurales del ADN. Universidad Autónoma de Puebla. 29 - 31 de Mayo de 1991.
Primera Reunión Nacional de Investigadores en Economía. Un Modelo Estocástico de Sustitución Tecnológica. UDLA. 10 - 12 de Octubre de 1991.
IX Congreso Nacional de Inmunología. Distribución de Aminoácidos de posiciones que determinan la especificidad de las inmunoglobulinas. Monterrey N.L 2 de Noviembre de 1991.
IX Reunión Nacional de Inteligencia Artificial Programa para Estimar la Complejidad Gramatical de una Secuencia. Veracruz, Ver. 27-31 de Julio de 1992.
XXV Congreso Nacional de la Sociedad Matemática Mexicana. Análisis de las Simetrías del Código Genético en Términos del Producto Cartesiano de 3 grupos-4 de Klein. Xalapa, Ver. Septiembre 27 al 3 de Octubre de 1992.
XXXV Congreso Nacional de Física. Simetrías del Código Genético y Restricciones Fisicoquimicas del ADN. Puebla,Puebla. 26-30 de octubre de 1992.
XIX Congress of Mexican Biochemical Society, Sociedad Española de Bioquímica. Variability and Conservation of Amino Acids in the Recognition site of the Inmunoglobulins: Analysis at the gene level. Ixtapa, Gro. 27 Septiembre - 2 Octubre de 1992
III Coloquio Nacional de Economía Matemática y Econometría. Importancia de las Fluctuaciones en las Etapas iniciales de la Sustitución Tecnológica. Ponente en la Mesa Redonda : Posibilidades y Limitaciones de las Aplicaciones de la Matemática a la Economía. CIMAT, Guanajuato. 4 - 19 de Julio de 1993
Workshop : Dynamical Systems an Biolinguistics 1.Biolinguistics: A personal Recollection 2. The Hypercube Representation of the Genetic Code (Con C. R. de la Mora B.). 3. Free Energy, Enthalpy and Entropy of Base Pairs and Symmetries of the Genetic Code. (con C.R. de la Mora Basañez). 4. Pattern Recognition in Immunoglobulins (con F. Lara-Ochoa and E. Vargas-Madrazo). UDLA/P, Cholula, Puebla. 20-22 Septiembre 1993.
XXXVI Congreso Nacional de Física. La Complejidad Gramatical y las Correlaciones de largo Alcance en el ADN. (con O. Chavoya-Aceves y M. Quintana-López) Acapulco, Guerrero. 18 - 22 de Octubre de 1993.
IV Encuentro de Investigación y Enseñanza de la Física. Aprendizaje Automático (Machine Learning) y Aplicaciones en Biofísica. Conferencia Plenaria, Universidad Autónoma de Puebla Puebla, Pue. 24 - 27 de Mayo de 1994.
V Coloquio Nacional de Economía Matemática y Econometría. Impacto de las Variaciones Bruscas de las Variables Macroeconómicas sobre la Distribución de la Renta. UNAM, México, D.F. 3-8 de Septiembre de 1995.
XXVIII Congreso Nacional de Matemáticas Hacia un Modelo Macroeconómico Estadístico de la Distribución del Ingreso, Universidad de Colima, Colima, Col. 1-7 de Octubre de 1995.
XXXVIII Congreso Nacional de Física. Genesys: Herramienta para el Análisis Físico-Químico del Código Genético, (con E. Amavizca-Ruiz) Universidad Autónoma de Zacatecas, Zacatecas, Zac. 16-20 de Octubre de 1995.
VI Coloquio Nacional de Economía Matemática y Econometría. Estimación de los parámetros de una densidad gama para describir la distribución del ingreso en México. (con S. Vargas y H. Peláez) Universidad de las Américas/Puebla. 23-27 de Septiembre de 1996.
Simposio sobre Investigación en las Humanidades Ciencia y Humanismo: Las dos Caras de Jano. Universidad de las Américas/Puebla 27 de Febrero de 1996.
XXXIX Congreso Nacional de Física Física Estructural Descriptiva. (con O. Alarcón) Universidad de Oaxaca, Oaxaca, Oax. 14-18 de Octubre de 1996.
VII Congreso de Economía Matemática y Econometría Un modelo estocástico de la trayectoria tecnológica Universidad Nacional Autónoma de México 6-10 Octubre 1997.
Primer Encuentro de Computación ENC 97 On the information content and algorithmic complexity of random sequences and biosequences. (con L. Zamora Cortina) Universidad Autónoma de Queretaro, Queretaro, Qro. 11-13 Septiembre de 1997
XL Congreso Nacional de Física Detección de patrones en trenes de señales nerviosas por métodos algorítmicos Universidad Autónoma de Nuevo León, Monterrey, N. L. 27-31 Octubre 1997
XLIII Congreso Nacional de Física Direccionalidad en la evolución molecular de organismos digitales y naturales. (con A. Morales Gallardo). Universidad Autónoma de Puebla. Puebla, Pue. 30 de octubre - 3 de noviembre, 2000
XXIII Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Bioquímica La importancia de los grupos funcionales en la caracterización de los residuos determinantes de la especificidad en las inmunoglobulinas. (con E. Culp y E. Villa Rodríguez) Acapulco, Gro. 19 - 24 de diciembre 2000.
XXIV Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Bioquímica Caracterización de las substituciones neutrales en la evolución divergente de proteínas. (con L. Nava Fernández) Puerto Vallarta, Jal. 3 – 8 de noviembre de 2002.
XLV Congreso Nacional de Física Factores termodinámicos en la distribución de la redundancia en el código genético. (con L. Nava Fernández) León, Gto. 28 octubre- 1º. De noviembre de 2002.
Encuentro de Inteligencia Artificial ENIA ´03. Alfabetos reducidos para la compactación de secuencias de proteínas empleando métodos de minería de datos. (con R. Del Ángel Ortiz, A. Ramos Fernández) Oaxtepec, Morelos 22-24 octubre de 2003.
XLVI Congreso Nacional de Física Agrupamientos de aminoácidos que conservan: a) la estabilidad termodinámica, b) el plegamiento proteínico, c) los polimorfismos del cambio de una base en el genoma humano. (con R. Del Ángel Ortiz). Mérida, Yucatán 27-31 octubre 2003.
XLVI Congreso Nacional de Física Simulación de un motor molecular (con F. Córdoba Valdés). Mérida, Yucatán 27-31 octubre 2003.
XLVII Congreso Nacional de Física A random walk generated via the game of life cellular automata. (con Bagatella Flores N., Hernández-Montoya A. R. ) Hermosillo, Sonora 25- 29 octubre 2004.
IV Encuentro Nacional de Biotecnología Aplicación de alfabetos reducidos para el análisis y diseño de proteínas Red de Biotecnología del IPN. Santa Cruz, Tlaxcala, México 10 al 12 de noviembre del 2004 (con A. Ramos-Fernández ).
IV Encuentro Nacional de Biotecnología Programa para generar secuencias de proteínas helicoidales Red de Biotecnología del IPN. Santa Cruz, Tlaxcala, México 10 al 12 de noviembre del 2004 (con C. J. Aguilar Palmeros, H. Lucio García, M. Jiménez García A.).
IV Encuentro Nacional de Biotecnología HyperGCode: una herramienta computacional para el análisis visual de las relaciones topológicas entre codones, aminoácidos y las propiedades de los aminoácidos. Red de Biotecnología del IPN. Santa Cruz, Tlaxcala, México 10 al 12 de noviembre del 2004 (con L. Nava Fernández ).
II Taller de Bioinformática y Biología Computacional Consenso de Alfabetos Reducidos de Aminoácidos y su Aplicación al Diseño de Secuencias de Proteínas Simplificadas. VI Encuentro Internacional de Ciencias de la Computación 26-30 Septiembre 2005. (con Lucio-García H. R., Ramos-Fernández A.)
II Taller de Bioinformática y Biología Computacional Análisis de secuencias de ADN con Wingramm 2. VI Encuentro Internacional de Ciencias de la Computación 26-30 Septiembre 2005. (con Sandria-Reynoso J. C.)
II Taller de Bioinformática y Biología Computacional Identificación de Secuencias Funcionales del Dominio 3´->5´ Exonucleasa de Polimesas de ADN (POL C) Mediante Alineamiento y Aplicación de Alfabetos Reducidos. VI Encuentro Internacional de Ciencias de la Computación 26-30 Septiembre 2005. (con Bárcenas-Pazos C., Cázares-Martínez J., Galicia-Castellanos S., Sandria-Reynoso J. C., Ronzón-Pérez P.)
II Taller de Bioinformática y Biología Computacional The Significance of Nucleotides Within DNA Codons: A Quantitative Approach. VI Encuentro Internacional de Ciencias de la Computación 26-30 Septiembre 2005. (con Guerra-Hernández A., De la Mora Basáñez C. R.
II Taller de Bioinformática y Biología Computacional In The Signal-to-Noise Distance Enough to Determine The Gene-Markers´ Class Label? A Preliminary Study Using Bayesian Networks. VI Encuentro Internacional de Ciencias de la Computación 26-30 Septiembre 2005. (con Cruz-Ramírez N., Ponce-Ruíz M. A.)
XLVIII Congreso Nacional de Física Gramáticas Estocásticas Para el Diseño de Proteínas Simplificadas. Universidad de Guadalajara, Jalisco. 17-21 Octubre 2005. (con Lucio-García H. R., Ramos-Fernández A.)
XLVIII Congreso Nacional de Física WGServices y WebGramm: Desarrollos Web para el Análisis de Secuencias de Símbolos y Series de Tiempo Digitalizadas. Universidad de Guadalajara, Jalisco. 17-21 Octubre 2005. (con Parra-Rosas S., Nava-Fernández L. A., Hernández-Montoya R. A.)
XLVIII Congreso Nacional de Física DFA de las fluctuaciones de una caminata aleatoria generada por medio del autómata celular The Game of Life (con R. Hernández-Montoya y G. A. Stevens-Ramírez) CUCEI, Universidad de Guadalajara. Guadalajara, Jal. 17-21 Octubre 2005.
XLIX Congreso Nacional de Física Ruptura de la Simetría Palindrómica en los Códigos Genéticos Alternativos (con Antero Ramos-Fernández) Universidad Autónoma de San Luis Potosí. San Luis Potosí, S. L. P. 16-20 Octubre 2006.
XXVI Congreso Nacional de la Sociedad Mexicana de Bioquímica, A. C. SimProt: Programa Computacional Para Generar Secuencias De Proteínas Simplificadas (con Del Ángel-Ortíz R., Lucio-García H. R. y Ramos-Fernández A.) Guanajuato, Gto. 12-17 Noviembre 2006.
2° Simposium de Medicina Genómica Caracterización de la Información Contenida en Secuencias de Proteínas Pseudoaleatorias Xalapa, Ver. 22 Noviembre 2006.
L Congreso Nacional de Física Factores Determinantes de la Sustituibilidad de los Aminoácidos en las Proteínas (con Antero Ramos-Fernández y Alexis Vázquez Villa) Boca del Río, Veracruz 29 de Octubre - 2 de Noviembre, 2007.
V Congreso Nacional de Virología An empirical method to identify positively selected sites in antigenic evolution (con Ramos-Fernández A.) Querétaro, Querétaro 24-27 Octubre 2007.
ESTANCIAS EN INSTITUCIONES O CENTRO DE INVESTIGACIÓN:
Investigador Visitante en: Universidad Wilhelm-Pieck, Rostock, República Democrática de Alemania; Enero y Febrero de 1976.
Centro de Investigación sobre Ingeniería Genética y Biotecnología, UNAM: Septiembre de 1986; y de Julio de 1987 a Junio de 1988.
Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno, UNAM: de Julio de 1987 a Junio de 1988.
Centro de Investigación de Estudios Avanzados del IPN: Marzo de 1989.
Innovationskolleg Theoretische Biologie, Humboldt-Universität zu Berlin: de Agosto de 1998 a Abril de 1999.
DISTINCIONES Y PREMIOS
Miembro de la Academia Mexicana de Ciencias desde Octubre de 2006
FULBRIGHT Fellow en el Departamento de Biofísica y Bioquímica de la Universidad de California, San Francisco. Agosto de 1982 - Junio de 1983.
Premio Universidad Veracruzana de Investigación (1989).
Primer premio Concurso Nacional de Divulgación Científica ANUIES (1990).
Beca de la Fundación Miguel Alemán, A.C. para Año Sabático, en el Area de Ciencias de la Salud (1990).
Segundo Premio Primer Concurso de Divulgación escrita de Temas de Frontera SOMEDICYT (19/04/1995)
Reconocimiento por desempeño académico relevante, Universidad Veracruzana (2003)
Reconocimiento por desempeño académico relevante, Universidad Veracruzana (2004)
Reconocimiento por desempeño académico relevante, Universidad Veracruzana (2005)
Reconocimiento por desempeño académico relevante, Universidad Veracruzana (2006)
Premio al Decano Universidad Veracruzana (14/05/2004).
OTROS
Revisor de: Physical Review E European Journal of physics
Physical Review Letters Origins of Life and Evolution of the Biosphere BioSystems Miembro fundador del Consejo Editorial de la Revista La Ciencia y el Hombre Juez del Premio Internacional The Origin of Life Prize, The Origin of Life Foundation. Vocal Científico del Consejo Directivo del Instituto Nacional de Investigación sobre Recursos Bióticos (1988).
Miembro del Consejo Editorial de la Universidad Veracruzana (2003-2005) Asesor Técnico del Consejo Veracruzano de Ciencia y Tecnología (2005 a la fecha) Coordinador del Cuerpo Académico de Investigación y Aplicaciones de la Inteligencia Artificial (2004 – a la fecha).
SOCIEDADES CIENTÍFICAS
New York Academy of Sciences
International Society for Computational Biology
Society for Chaos Theory in Psychology & Life Sciences
American Mathematical Society
Sociedad Mexicana de Física
Sociedad Matemática Mexicana
Phi-Beta-Delta Honor Society
Academia Mexicana de Ciencias
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| Supplementary material - Irreplaceable Amino Acids and Reduced Alphabets in Short-term and Directed Protein Evolution | |||
| Supplementary material - Codon substitution probability distributions of replaceable and irreplaceable amino acids in short-term evolution | |||
| Revista Mexicana de Física | Coronel-Brizio H. F, Hernández-Montoya A. R., Jiménez-Montaño M.A.,. Mora-Forsbach L. E. (2007). Una prueba empírica de generadores de números pseudoaleatorios mediante un proceso de decaimiento exponencial. Revista Mexicana de Física, Vol. 53 (5): 350-357. |
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Jiménez-Montaño M. A (2006). Las dos caras de Jano de la biología molecular: los aspectos físico-químicos e informacionales del lenguaje genético, en: La Física Biológica en México: Temas Selectos .L. García-Colín S.,P.Miramontes, A. Rojo, L. Dagdug (Eds.). El Colegio Nacional. México, D. F. Octubre 2006. 421-436. |
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| Periodicum Biologorum | Jiménez-Montaño M. A., Lucio-García H. R., Ramos-Fernández A. (2005). Computer Simulation to Generate Simplified Proteins With Stochastic Grammars. Periodicum Biologorum. Vol. 107 (4): 397-402. |
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| World Scientific Pu. Co. Singapur | Jiménez-Montaño M. A. (2005). Applications of Hyper Genetic Code to Bioinformatics. In Advances in Bioinformatics and Its Applications. Matthew He, Giri Narasimhan, Sergei Petoukhov (Eds.). World Scientific Pu. Co. Singapur. 473-481 |
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Cruz Ramirez N., Ponce Ruiz. M.A., Jiménez Montaño M. A. , Acosta Mesa H. G. (2005). Is the signal-to-noise distance enough to determine the gene-markers’ class label? a preliminary study using Bayesian networks, en Avances en la Ciencia de la Computación 2005. L. Villaseñor, A. Martínez (Eds.) pp. 155-158. SMCC, México. |
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Sandria-Reynoso J. C. Jiménez Montaño M. A.(2005). Análisis de secuencias de ADN con Wingramm 2, en Avances en la Ciencia de la Computación. L. Villaseñor, A Martínez (Eds.) pp. 159-162. SMCC, México. |
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Jiménez-Montaño M.A., Ramos Fernández A., Lucio García H.R. (2005).Consenso de alfabetos reducidos de aminoácidos y su aplicación al diseño de secuencias de proteínas simplificadas, en Avances en la Ciencia de la Computación 2005. L. Villaseñor, a. Martínez (Eds.) pp. 163-166. SMCC, México. |
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Guerra Hernández A., Jiménez-Montaño M.A , de la Mora Basáñez C. R. (2005). The significance of nucleotides within DNA codons: a quantitative approach, en Avances en la Ciencia de la Computación. L.Villaseñor, A. Martínez (Eds.) pp. 167-169. SMCC, México. |
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Bárcenas-Pazos C, Cázares-Martínez J., Galicia-Castellanos S., Sandria Reynoso J. C.,Ronzón-Pérez P., Jiménez-Montaño M.A. (2005). Identificación de secuencias funcionales del dominio 3’-5’ exonucleasa de polimerasas de adn (pol c) mediante alineamiento y aplicación de alfabetos reducidos, en Avances en la Ciencia de la Computación. L. Villaseñor, A. Martínez (Eds.) pp. 170-173. SMCC, México. |
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| World Scientific Pu. Co. Singapur | Jiménez-Montaño M. A. (2004). Applications of Hyper Genetic Code to Bioinformatics. Journal of Biological Systems. Vol. 12: 5-20. |
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| Nonlinear Dynamics, Psychology & Life sciences | Jiménez-Montaño M. A. , Feistel R., Diez-Martínez O. (2004). Information Hidden in Signals and Macromolecules I. Symbolic Time-series Analysis. Nonlinear Dynamics, Psychology & Life sciences. Vol. 8 (4): 445-478. |
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| Springer-Verlag | Ebeling W., Jiménez-Montaño M. A., Pohl T. (2003) Entropy and Complexity of Sequences. In Entropy Measures, Maximum Entropy Principles and Emerging Applications. Karmeshu (Ed.). Studies in Fuzziness and Soft Computing. Vol. 119: 209-227. Springer-Verlag, Berlin. |
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| BioSystems | Jiménez-Montaño M.A., Ebeling W., Pohl T., Rapp P.E. (2002) Entropy and complexity of finite sequences as fluctuating quantities. BioSystems, Vol. 64: 23-32. |
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| APS Journals | Rapp P. E., Cellucci C.J., Korslund K.E., Watanabe T.A.A., Jiménez-Montaño M.A. (2001) Effective normalization of complexity measurements for epoch length and sampling frequency. Physical Review E, Vol. 64: 016209. |
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| Springer-Verlag |  |
Ebeling W., Jiménez-Montaño M. A., Pohl T. (2001) Entropy and Complexity of Sequences. In Entropy Measures, Maximum Entropy Principles and Emerging Applications. Karmeshu (Ed.) Springer-Verlag, Berlin. |
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| The European Physical Journal B | Steuer R. , Molgedey L., Ebeling W., Jiménez-Montaño M.A (2001) Entropy and optimal partition for data analysis. The European Physical Journal B. Vol 19: 265-269. |
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| BioSystems | Jiménez-Montaño M.A., Penagos H., Hernández-Torres A., O. Díez-Martínez (2000) Measures of complexity in neural spike-trains of the slowly adapting stretch receptor organs. BioSystems. Vol. 58: 117-124. |
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| Journal of Theoretical Biology | Weiss O., Jiménez-Montaño M.A, Herzel H. (2000) Information content of protein sequences. J. Theor. Biol., Vol 206: 379-386 . |
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| BioSystems | Jiménez-Montaño M.A (1999) Protein Evolution Drives the Evolution of the Genetic Code and Vice Versa. BioSystems Vol. 54: 47-64. |
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| Springer-Verlag | |
Ebeling W., Scharnhorst A., Jiménez-Montaño M. A., Karmeshu (1999) Evolutions-und Innovationsdynamik als Suchprozess in Komplexen Adaptiven Landschaften. Komplexe Systeme und Nichtlineare Dynamik in Natur und Gesellschaft, K. Mainzer (Ed.) Springer-Verlag. Berlin. 447-473. |
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| BioSystems | Jiménez-Montaño M.A. and Lara-Ochoa F. (1991) On the Skew Distribution of Immunoglobulins and the Inverted Protein-Folding Problem. BioSystems, Vol. 24: 261-267. |
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| La Ciencia y el Hombre | |
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| Mathematical Biosciences | Ebeling W.,Jiménez-Montaño M. A. (1980).On Grammars, Complexity, and Information Measures of Biological Macromolecules. Mathematical Biosciences Vol. 52:53-71. |
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Ebeling W., Feistel R.,Jiménez-Montaño M. A. (1977). On the Theory of Stochastic Replication and Evolution of Molecular Sequences. Rostoker Physik Manuskripte: Vol. 2: 105- 127. |
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Meeting Posters (2002)
| Congreso Nacional de Física | Factores Termodinámicos en la Distribución de la Redundancia en el Código Genético |
| Congreso Nacional de Física | Thermodynamical Factors in the Redundance Distribution of the Genetic Code |
| Congreso Nacional de Bioquímica | Caracterización de las Substituciones Neutrales el la Evolución Divergente de Proteinas |
Meeting Posters (2003)
| Congreso Nacional de Física | Agrupamientos De Aminoácidos Que Conservan: A) La Estabilidad Termodinámica, B) El Plegamiento Proteínico, C) Los Polimorfismos Del Cambio De Una Base En El Genoma Humano |
| 3er. Encuentro De Inteligencia Artificial Enia'03 | Alfabetos Reducidos Para La Compactación De Secuencias De Proteínas Empleando Métodos De Minería De Datos |
Meeting Posters (2004)
| IV Encuentro Nacional De Biotecnología IPN | HyperGCode: Una Herramienta Computacional Para El Análisis Visual De Las Relaciones Topológicas Entre Codones, Aminoácidos Y Las Propiedades De Los Aminoácidos |
| IV Encuentro Nacional De Biotecnología IPN | Aplicación De Alfabetos Reducidos Para El Análisis Y Diseño De Proteínas |
Meeting Posters (2005)
| Simposium Medicina Genómica | Fundamentos Teóricos de la Bioinformática |
| II Taller de Bioinformática y Biología Computacional | Consenso de Alfabetos Reducidos de Aminoácidos y su Aplicación al Diseño de Secuencias de Proteínas Simplificadas |
| II Taller de Bioinformática y Biología Computacional | Análisis de Secuencias de DNA con Wingramm 2 |
| II Taller de Bioinformática y Biología Computacional | Identificación de secuencias Funcionales del Dominio 3´-> 5´ Exonucleasas de Polimerasas de DNA (Pol C) Mediante Alineamiento y Aplicación de Alfabetos Reducidos |
| Congreso Nacional de Física | Gramáticas Estocásticas para el Diseño de Proteínas Simplificadas |
Meeting Posters (2006)
| Congreso Nacional de Física | Ruptura de la Simetría Palindrómica en los Códigos Genéticos Alternativos |
| Congreso Nacional de Bioquímica | SimProt: Programa Computacional Para Generar Secuencias De Proteínas Simplificadas |
| 2° Simposium Medicina Genómica | Caracterización de la Información Contenida en Secuencias de Proteínas Pseudoaleatorias |
| Congreso Nacional de Física | Factores Determinantes de la Sustituibilidad de los Aminoácidos en las Proteínas |
| Congreso Nacional de Virología | An empirical method to identify positively selected sites in antigenic evolution |
Meeting Posters (2007)
Position:------------- Profesor - Investigador Titular C de Tiempo Completo
Campus:------------ Facultad de Física e Inteligencia Artificial, Universidad Veracruzana
Address mail:----- Sebastián Camacho #5, Centro C.P. 91000, Xalapa Ver. México.
Phone:--------------- (228) 817-29-57
Fax:------------------- (228) 817-28-55
e-mail:---------------- ajimenez@uv.mx
COLABORADOR
Q.F.B. Antero Ramos Fernández (Becario SNI)
e-mail-----------------antramos@uv.mx
Nivel II Área de la ciencia: Física
Disciplina: Biofísica
Especialidad: Biofísica molecular computacional